与强盛时期攻无不克，战无不胜的蒙古铁骑相比，元朝的海上战力虽然也是世界上领先的水准，但却常常为人诟病，这就不得不说到在元初忽必烈时期带有神秘色彩的两次失败战役。
忽必烈建立元朝后，曾意图使日本国与其他政权和民族一样臣服于蒙古人，所以他曾经几次派遣使者到日本，要求其无条件归顺。
公元1274年，在连番被拒之后，忽必烈对此感到异常的耻辱，于是不顾当时麾下的部队正与南宋交战正酣，便毅然决然地下令准备船只和粮饷，向日本发起了攻势，这也是元朝海军第一次东征日本。
这次战役中元朝海军虽然在初期占了一些优势，攻占了日本两岛，但当时的海军并没有选择在岸上安营扎寨，而是选择于夜宿船舰之上。
当夜，一场忽如其来的暴风雨击沉了元军两百多艘船舰，剩余军队也不得不因此撤退，是以日本侥幸取胜，免于亡国。
忽必烈听到这个消息以后感到非常震惊，他没想到一个弹丸小国能与自己战无不胜的军队相抗衡，心中更加想要覆灭这个国家，但当时正在消灭南宋的最后阶段，忽必烈只能先行派遣使者继续劝降日本。
但这一次，因为上次成功而变得骄傲的日本人，居然直接斩杀了忽必烈派去的使臣！
这对于忽必烈来说是最大程度上的侮辱，于是在公元1281年，元朝海军第二次东征日本。
由于南宋已灭，所以忽必烈可以腾出手来，派出大量的部队，分两路进攻。
但是因为江南军的部队人数和辎重太多，导致行动迟缓，没有按时与东路军合兵一处，所以等待不及的东路军先行发起了进攻。
自上一次与元朝海军对战以后，日本的防守军队已经有了一定的防守经验，他们利用充分的防御工事和精锐部队与东路军交战，将其击退。
直到东路军败退，江南部队才赶到与其会合，但会合后的元军却因蒙古、高丽、汉军各部统率之间的矛盾而不能协调作战，于是双方对峙长达两个多月，直至一场恐怖的台风袭击了元军营地所在的海岸……
光是这场台风，便使东路军折损三成以上的部队，江南军更是伤亡过半，来不及撤退的部队则在日本士兵的追击下屠杀或跳海溺死。
至此，元朝海军的两次东征皆因突如其来的天灾而宣告失败。
盛怒的忽必烈仍想继续对日本进行第三次东征，但最终迫于朝廷财政的压力也无奈放弃。
这两次东征的失败除了元军运气不好，遭遇了两次恐怖的天灾以外，还受到一个客观事实的约束。
那就是这个时代的海战主要是以运输兵力过海为目的，可以看成与抢滩登陆战类似，而并非后世理解上的双方船舰在海上决战。
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